Estudio Prospectivo de la Ciudad de México Política de Uso Compartido de Datos y Muestras (versión 5.2)

Dado que el EPCM ha recolectado información sobre diversas exposiciones y resultados de salud durante un período de varios años, el involucramiento de una amplia gama de investigadores es necesario para determinar las preguntas de investigación a abordar y definir los métodos óptimos para abordar dichas preguntas. En su rol de depositario responsable de datos, el grupo de EPCM debe mantener la integridad de la base de datos para su uso en el futuro así como regular el uso de dicha base de datos. Los datos podrán ser distribuidos fuera del grupo de EPCM sólo bajo condiciones de seguridad apropiadas y mediante previa aprobación. Esta política de uso de datos está sustentada en la necesidad de:

• Proteger a los participantes y actuar dentro del alcance del consentimiento informado que fue firmado por ellos.
• Garantizar el apego a todas las leyes y regulaciones aplicables respecto al uso, resguardo, y eliminación de los datos y/o las muestras.
• Garantizar que la investigación fomentada es de alta calidad y que producirá avances en el conocimiento. Aquellas solicitudes en las que colaboradores mexicanos sean incluidos son especialmente bienvenidas, puesto que contribuyen al desarrollo y fortalecimiento de capacidades en investigadores locales.
• Garantizar que la seguridad de los datos y la confidencialidad de los participantes sean preservados.
• Promover el desarrollo de capacidad local. Existe la aspiración a que los datos del EPCM no sólo sean utilizados para generar hallazgos científicos de importancia sino también que sean de ayuda para el desarrollo de capacidades de investigación de forma local.
• Proporcionar resultados académicos y oportunidades de entrenamiento para los investigadores desarrollando el estudio, en especial para estudiantes de doctorado e investigadores jóvenes quienes estén desarrollando sus habilidades y competencias científicas mediante su trabajo en la cohorte.

3.1. Componentes clave de la Política de Uso Compartido de Datos y Muestras

Colaboraciones

El grupo de investigación del EPCM se encuentra buscando activamente y respondiendo a las solicitudes de colaboración científica en proyectos específicos, en especial cuando estén planteadas en el marco del fortalecimiento de la capacidad de investigación en México. Este modelo de colaboración facilitada con investigadores externos será adoptado cuando éste incremente el valor y calidad de los datos. Las colaboraciones serán regidas por un Convenio o Acuerdo de Colaboración independiente, el cual: (i) designará a un líder de proyecto dentro del grupo de EPCM en México y/o en RU; (ii) detallará los acuerdos de co-autoría o producción de artículos científicos; (iii) abarcará las cuestiones de propiedad intelectual; (iv) detallará los compromisos de financiamiento, si procede.

Disponibilidad de Datos para Acceso Libre

Previo a la aprobación del uso de datos para cualquier análisis, los integrantes del equipo del EPCM responsables de generar los datos deberán emprender los procesos requeridos de limpieza, procesamiento, control de calidad e integración de datos. En cuanto las bases de datos se encuentre limpia, ésta se encontrará disponible de forma inmediata para uso de acceso libre por investigadores quienes soliciten acceso desde una institución mexicana, siempre que el proyecto propuesto no se superponga considerablemente con los proyectos que se estén
llevando a cabo por los investigadores de México u Oxford (Proyectos de investigación completados y protegidos). Este periodo de acceso exclusivo para investigadores mexicanos será de 2 años, posterior al cual las bases de datos estarán disponibles para acceso libre por cualquier investigador de buena fe mundialmente (ver Los datos disponibles).

Supervisión Independiente del Uso

Las decisiones iniciales respecto a las solicitudes de acceso a los datos son tomadas por el equipo de EPCM. El Comité de Supervisión de Uso de Datos del Nuffield Department of Population Health da asesoramiento en el escrutinio y gobernanza de los procesos de uso compartido de datos, cuando es necesario. El solicitante puede presentar una apelación con este comité si se encuentra en desacuerdo con alguna decisión por parte del estudio respecto al uso de datos.

Protección de la Identidad de los Participantes

Se mantienen medidas preventivas para asegurar la anonimidad y la confidencialidad de los datos de los participantes. Los investigadores tendrán que celebrar un acuerdo legal en el que aceptan no intentar identificar a los participantes, y los datos entregados a los investigadores no contendrán variables con información de identificación personal (es decir, cada base de datos entregada será “pseudoanonimizada” con un identificador único para cada participante [PIDs]).

Seguridad de Datos

Todos los datos del EPCM se encuentran resguardados en servidores protegidos en un repositorio de datos centralizado que cumple con los estándares internacionales sobre gobernanza de información. Un equipo de gerencia de datos funge como guardián de los datos y se asegura de que todos los datos compartidos son entregados a través de un sistema de entrega seguro y en un formato apropiado.

Conservación y Uso de Muestras

Solamente 10 ml de sangre fueron obtenidos en la encuesta basal y en la re-encuesta de cada participante, los cuales fueron separados en una muestra de capa leucocitaria y dos a tres muestras de plasma que están resguardadas en Oxford. En la re-encuesta, una muestra urinaria fue obtenida en poco menos de la mitad de los participantes re-encuestados (durante la segunda mitad del período de levantamiento de datos). Dado que el volumen de estas muestras es sumamente limitado, el uso de las mismas está estricta y cuidadosamente controlado. Por lo tanto, en lugar de analizar las muestras en el marco de estudios de casos y controles (lo cual es costo-efectivo para estudiar enfermedades específicas, pero no lo es en el contexto de un recurso que será usado para estudiar diversas enfermedades por varios investigadores), el análisis de las muestras de todos los participantes es mucho más conveniente. Esta estrategia maximiza la información disponible para los investigadores mientras que minimiza el agotamiento de la muestra y facilita la comparación de resultados en toda la cohorte dado que la metodología y el control de calidad de los análisis será consistente. Son bienvenidas las propuestas para realizar análisis específicos en las muestras y todos los resultados obtenidos serán parte de los datos disponibles para uso compartido o acceso libre. En general (como es el caso de UK Biobank), no se espera que el Comité de Uso de Datos acepte solicitudes de acceso directo a muestras.

Cuotas por el acceso de datos

El acceso libre de datos está disponible de forma gratuita a los solicitantes de países de Ingresos Bajos y Medios. Investigadores basados en países de Ingresos Altos incurrirán en un cargo de uso por cada solicitud de uso de datos aprobada (actualmente, £2500 GPB previo a la entrega de los datos solicitados). Este cargo contribuye a los costos administrativos asociados con la revisión de la solicitud y la gestión y preparación de los datos. A los investigadores en colaboración se les podrá requerir cubrir los costos administrativos asociados con el uso compartido de datos (incluyendo honorarios por servicios legales, si aplica), incluyendo la recuperación, procesamiento, y envío de los datos o muestras. Los costos estimados de cada solicitud serán comunicados durante el desarrollo de la propuesta de proyecto.

Colaboradores potenciales y solicitantes de datos deberán contactar a los investigadores del EPCM en primera instancia o revisar el sitio web del estudio (incluyendo las publicaciones del EPCM), el Data Showcase y el Variant Browser para informarse acerca de los datos disponibles y los proyectos que ya han sido completados previamente o que están en curso. El Data Showcase del EPCM tiene los objetivos de: 1) presentar los datos del estudio disponibles para investigación en salud de forma comprensiva y concisa; y 2) proveer información adicional para aquellos investigadores quienes estén considerando solicitar acceso al uso de estos datos.

4.1 Solicitudes de colaboración

Los investigadores que estén interesados en colaborar en proyectos con los investigadores del EPCM tanto en México o en el RU son exhortados a contactar al grupo de EPCM de forma directa en primera instancia por correo electrónico o contactar a los investigadores relevantes para discutir ideas de investigación y su viabilidad. Las solicitudes deberán incluir un título de proyecto y una breve descripción de la propuesta de investigación y los datos de interés. Cada proyecto requerirá de un co-investigador miembro del grupo de EPCM que tenga interés compartido en el proyecto y experiencia de investigación relevante o complementaria. Una vez identificados, el colaborador y el co-investigador desarrollarán en conjunto una propuesta de investigación que tendrá que ser evaluada por el Comité Directivo del EPCM.

4.2 Solicitudes de Acceso Libre de Datos

Registro / Elegibilidad

A todos los solicitantes de acceso libre de datos se les solicita en primera instancia completar el formato de Registro para Uso de Datos del EPCM (disponible en Español e Inglés) y enviarlo a mcps-access@ndph.ox.ac.uk. Los Solicitantes deberán ser empleados de una institución académica reconocida, o de una organización de servicios de salud, o de una organización caritativa de investigación, que tenga experiencia en investigación médica. Deberán ser capaces de demostrar con claridad, a través de la autoría de publicaciones arbitradas en el área de interés, su capacidad de realizar investigación de forma independiente.

Entrega de Solicitud de Datos

Una vez obtenida la aprobación de registro, a los solicitantes se les harán llegar los formatos de EPCM Formato de Solicitud de Datos, los cuales deberán ser completados y enviados a mcps-access@ndph.ox.ac.uk. Este formato requiere que el solicitante entregue: un título de proyecto y un resumen; justificación científica / metodología; resultados esperados y cronograma del proyecto. Apartados adicionales incluyen preguntas sobre cuestiones éticas, colaboradores y equipo de investigación, fondos para el proyecto y seguridad de datos, y las variables solicitadas para el proyecto.

Evaluación de la solicitud de uso de datos

Las solicitudes de acceso libre de datos serán inicialmente evaluadas por el equipo de EPCM. Cada solicitud será considerada por su mérito individual. En caso necesario, se buscará obtener una evaluación arbitrada independiente. Los proyectos aprobados: (i) tendrán objetivos puntualmente definidos; (ii) incluirán una metodología sólida que factiblemente generará resultados valiosos; (iii) estarán basados en una selección apropiada de los datos disponibles; (iv) tendrán un cronograma y productos científicos (p. ej. 1-2 artículos publicados en revistas arbitradas) puntualmente definidos. Los proyectos que se superpongan significativamente con aquellos que están llevando a cabo los investigadores del EPCM podrían ser rechazados.

El equipo del EPCM usualmente evaluará y responderá a las solicitudes de datos en un plazo de dos a cuatro semanas. El solicitante podrá apelar con el Comité de Supervisión de Uso de Datos del Nuffield Department of Population Health si su solicitud es rechazada por el equipo del proyecto mediante este formulario.

Una vez que las propuestas sean aprobadas, las siguientes condiciones y procesos son requeridos como condiciones del uso de datos:

Convenio o Acuerdo de Transferencia de Datos

Previo a que los datos sean compartidos, un acuerdo de transferencia deberá ser celebrado entre la institución a la que el solicitante está adscrito y la University of Oxford. Este acuerdo será enviado al Solicitante una vez que la solicitud sea aprobada, e incluirá una copia de la propuesta de proyecto, así como un calendario.

Firmante

El Solicitante deberá fungir como miembro representate de una institución académica reconocida, una organización de investigación, o una organización de salud. Su solicitud deberá provenir de una dirección de correo electrónico con dominio oficial de la institución. La organización deberá tener políticas y procedimientos formales (p. ej. IG Tookit, certificación ISO 27001, o una evaluación de su política de seguridad a nivel sistémico) que le permitan cumplir con las consideraciones legales, éticas, y de seguridad de datos y asegurar que las bases de datos sean
resguardadas de forma segura y usadas de forma responsable.

Aprobación de Comités de Ética y de Gobernanza de Investigación

Cuando proceda, es responsabilidad del solicitante obtener la aprobación del proyecto por parte del Comité de Ética correspondiente. El solicitante, en conjunto con los investigadores del estudio, podrán estar sujetos a solicitar aprobación del proyecto por parte del Comité de Ética en Investigación responsable del EPCM. La aprobación del proyecto por comités de gobernanza de investigación local y/o de investigación y desarrollo (R&D), cuando proceda, son responsabilidad del solicitante. Las aprobaciones correspondientes deberán estar resueltas previo a cualquier transferencia de datos.

Restricciones de Uso

Los datos podrán ser usados sólo para fines de investigación médica y dentro de las limitantes del consentimiento mediante el cual los datos fueron originalmente recolectados y de cualquiera de los acuerdos contractuales entre el EPCM y sus donantes o fuentes externas de datos. El acceso será permitido para aquellos proyectos de investigación que sean consistente con la descripción del proyecto original, que hayan sido ética y científicamente aprobados por revisores independientes apropiados y cuando el uso de los datos será usado para el beneficio demostrable de la salud y/o la sociedad. Los datos otorgados sólo podrán ser compartidos con los solicitantes nombrados al momento de la solicitud original o en solicitudes subsecuentes que estén especificados en el Convenio o Acuerdo de Uso de Datos o en enmiendas posteriores. Los datos no podrán ser compartidos con individuos fuera del grupo de investigación del solicitante sin una aprobación formal por parte de los Investigadores Principales del EPCM.

Datos de Identificación

Los datos entregados a los investigadores no contendrán variables con datos que sean de identificación personal. Las bases de datos serán ’pseudoanonimizadas’ mediante la asignación de identificadores personales encriptados (PIDs). El Convenio o Acuerdo de Uso de Datos contendrá garantías de confidencialidad para poder salvaguardar la privacidad de los participantes. Los receptores deberán aceptar no ligar los datos pseudoanonimizados con ningún otro tipo de base de datos sin previa autorización. Los receptores no deberán intentar identificar a algún individuo contenido en la base de datos. En caso de que los receptores tengan motivos para creer que algún individuo ha sido identificado involuntariamente, no deberán realizar registro alguno, ni compartir esta información con cualquier otra persona, ni intentar contactar al individuo.

Propiedad Intelectual

Todos los derechos de Propiedad Intelectual (PI) en los datos son y permanecerán siendo en todo momento propiedad de la Universidad Nacional Autónoma de México y la University of Oxford. Toda la PI generada será otorgada y será propiedad de los solicitantes. Los solicitantes deberán cubrir cualquier costo asociado con la protección de la PI generada. Los Solicitantes deberán poner inmediatamente en conocimiento a los Investigadores Principales en caso de que alguna PI sea generada. A la Universidad Nacional Autónoma de México y la University of Oxford se les otorgaran los derechos de uso de toda la PI generada para fines académicos y de investigación, incluyendo investigación mediante proyectos fondeados por terceros, siempre y cuando aquellos terceros no ganen o reclamen derechos sobre la PI en cuestión.

Pago del Cargo por Uso de Datos

Se espera que los solicitantes de datos de instituciones en países de ingresos altos paguen un cargo de uso de datos para cubrir los costos administrativos para el estudio en el proceso de evaluación de la solicitud y la preparación de los datos para su uso compartido, etc. En caso de que lo anterior sea aplicable, los datos no serán entregados al Solicitante hasta que, o a menos que, la cuota de uso de datos haya sido recibida en su totalidad.

Liberación de Datos y Entrega

Una vez que la propuesta haya sido aprobada y el Convenio o Acuerdo de Uso de Datos haya sido firmado, los datos y la documentación correspondiente serán generados en formato CSV (o el que haya sido pre-especificado) y posteriormente encriptado y entregado de forma segura. Los datos genómicos se compartirán otorgando acceso a una plataforma de análisis de investigación en línea habilitada por la tecnología DNAnexus y soportada por AWS, donde los investigadores podrán acceder a los datos genéticos y no genómicos, realizar sus análisis y descargar sus resultados. El acceso a los datos de EPCM a través de la plataforma DNAnexus será al menos hasta marzo de 2029.

Publicidad y Divulgación

El grupo de EPCM se reserva los derechos de publicar el título, (los) nombre(s) y (las) afiliación(es) del Investigador Principal (o los Investigadores Principales), un resumen sencillo y el resumen científico de cada pieza de investigación colaborativa para la cual se haya otorgado acceso al uso de algún recurso, previo a la identificación o publicación de resultados. Los Solicitantes que no deseen que los detalles de su estudio sean hechos abiertamente disponibles deberán indicarlo en su solicitud de acceso a datos y describir el motivo. El solicitante no podrá usar el nombre, marca, o logo de la Universidad Nacional Autónoma de México o la University of Oxford en comunicados de prensa, productos de publicidad, o para cualquier propósito comercial, sin consentimiento escrito previo.

Autoría y Aprobaciones

Los Acuerdos de Uso de Datos especificarán las expectativas de autorías y de reconocimientos en los productos de investigación. Las colaboraciones requieren por lo menos una co-autoría de alguno de los miembros del grupo de EPCM. Para los Convenios o Acuerdos de Acceso Libre de Datos no se requerirá autoría de algún miembro del equipo del EPCM, pero a los solicitantes se les solicitará que entreguen al equipo del EPCM el manuscrito de cualquier publicación propuesta no menos de 30 días previo a su entrega para publicación.

Publicaciones y Acceso Libre

Todas las publicaciones de resultados en una revista arbitrada, o en forma de monografía académica o capítulo de libro, deberá ponerse a disposición desde PubMed Central y Europe PubMed Central tan pronto como sea posible y en no más de seis meses después de la fecha final de publicación. Los requerimientos de la revista en torno a la liberación y deposición de datos posterior a la publicación de un artículo deberán ser discutidos con y aprobados por los EPCMInvestigadores Principales de EPCM previo a la entrega de un manuscrito.

Integración de los Datos

Al finalizar el trabajo relacionado con el uso de datos del EPCM liberados, las bases de datos originales, así como cualquier base de datos derivada y/o variables generadas con motivo del proyecto deberán ser retornados al repositorio central del EPCM para archivarse y/o añadirse a la base de datos primaria para uso futuro. Si se considera apropiado, el equipo del EPCM podrá realizar revisiones independientes y/o validación de los datos y resultados para asegurar que la integridad y confiablidad de los datos, así como los resultados derivados de los mismos, es mantenida.

Monitoreo y Rendición de Cuentas: Los solicitantes deberán entregar reportes anuales y cualquier otra información que sea razonablemente requerida para dar fe del trabajo realizado en correspondencia con el proyecto propuesto. Si existe una desviación substancial o un cambio en los planes del uso de los datos, se deberá solicitar aprobación subsecuente. Si se presentan retrasos o dificultades substanciales para completar el proyecto propuesto, el grupo de EPCM tendrá el derecho, previa consulta con el Comité de Supervisión de Uso de Datos del Nuffield Department of Population Health, de suspender el proyecto si a su consideración hay muy limitada probabilidad de que el problema sea resuelto. Bajo dichas circunstancias, todos los datos que hayan sido entregados deberán ser eliminados y un certificado de dicha eliminación deberá ser entregado.

Para una descripción completa, revisar el Data Showcase de EPCM. El showcase muestra todos los datos que se encuentran disponibles al momento, presentando la información de forma agrupada (no a nivel individual), además de detalles de cada campo (p. ej. descripción de cómo ciertas mediciones fueron obtenidas). La variación genética se puede ver utilizando un buscador en línea de variantes disponibles en EPCM.

Detallado de los datos actualmente disponibles para investigadores a nivel mundial

Encuesta basal (1998-2004) Disponible para 159,517 participantes

Mes y año de reclutamiento

Socio-demográficos

• Edad
• Sexo
• Área de residencia 
• Estado civil
• Nivel educativo
• Ocupación
• Ingreso
• Proveedor de servicios de salud

Estilo de vida

• Consimo de tabaco
• Exposición pasiva a humo de tabaco
• Consumo de alcohol
• Actividad física
• Duración de sueño
• Consumo de frutas/vegetales
• Consumo de alimentos fritos
• Tipo de aceite comestible consumido

Enfermedades y uso de medicamentos

Historia reproductiva (mujeres)

• Menopausia
• Histerectomía
• Ooforectomía
• Terapia de reemplazo hormonal
• Uso de anti-conceptivos
• Edad de inicio de actividad sexual
• Edad de primer embarazo
• Número de embarazos

Antropometría

• Talla
• Peso
• Circumferencia de cintura
• Circumferencia de cadera
• Presión arterial sistólica
• Presión arterial diastólica

Muestras de sangre

• Timepo de la toma de muestra
• Tiempo desde el ultimo alimento
• Hemoglobina glicosilada

Re-encuesta (2015-2019) Disponible para 10,143 participantes. Similar a los datos recolectados en la encuesta basal más

Información adicional del cuestionario

• Preguntas de control de diabetes
• Complicaciones de diabetes (eg,ojos, amputaciones, diálisis)
• Fracturas y caídas
• Tratamiento de cancer de mama
• Preguntas adicionales sobre dieta (eg, bebidas azucaradas, sal agreada, carne, pescado, postre, dieta)
• Función cognitiva (MMSE) 

Mediciones adicionales

• Bioimpedancia (masa grasa, masa libre de grasa, masa muscular, score muscular, masa ósea, agua corporal, nivel de obesidad, grasa visceral, tasa metabólica basal, edad metabólica, índice de Rohrer)

Muestras adicionales

• Tiempo de muestreo urinario
• Creatinina urinaria
• Albúmina urinaria 

Datos de NMR metabolomics usando la plataforma de Nightingale Health Primer lanzamiento: 40,297 participantes

14 subclases de lipoproteínas

• XXL VLDL
• XL VLDL
• L VLDL
• M VLDL
• S VLDL
• XS VLDL
• IDL
• L LDL
• M LDL
• S LDL
• XL HDL
• L HDL
• M HDL
• S HDL

Tamaño promedio de lipoproteínas y apolipoproteínas

• VLDL-D
• LDL-D
• HDL-D
• Apo A1
• Apo B

Colinas y metabolitos relacionados con la glucólisis

• Colinas totals
• Fosfatidilcolina
• Esfingomielina
• Lactato
• Citrato
• Glucosa

7 mediciones lipídicas por cada subclase

• Número de partículas
• Colesterol
• Colesterol libre
• Colesterol esterificado
• Triglicéridos
• Fosfolípidos
• Lípidos totales

Ácidos grasos

• Poliinsaturados
• Monoinsaturados
• Saturados
• Ácido
• docosahexaenoico
• Ácido linoleico
• Omega-3
• Omega-6
• Ácidos grasos totales

Amino ácidos

• Alanina
• Glutamina
• Histidina
• Isoleucina
•  Leucina
• Valina
• Fenilalanina
• Tirosina

Cuerpos cetónicos, inflamación, y función renal

• Acetato
• Acetona
• β-hydroxy-butirato
• Albúmina
• Creatinina
•  Acetiles de glycoproteína

Datos de mortalidad (hasta el 30 de Septiembre de 2022)

• Fecha de fallecimiento
• Causa básica de muerte ICD-10
• Causas que contribuyeron a la muerte ICD-10
• Tiempo de duración de enfermedades
• Lugar de defunción 
•  Visto por medico previo a defunción 

Apo A1=apolipoproteína A1; Apo B=apolipoproteína B; HDL=high density lipoproteins (lipoproteínas de alta densidad); HDL−D=high density lipoprotein particle diameter (diámetro de HDL); IDL=intermediate density lipoproteins (lipoproteína de densidad intermedia); L=large (grande); LDL=low density lipoproteins (lipoproteína de baja densidad); LDL−D=low density lipoprotein particle diameter (diámetro de LDL); M=medium (mediano); S=small (pequeño); VLDL=very low density lipoproteins (lipoproteína de muy baja densidad); VLDL−D=very low density lipoprotein particle diameter (diámetro de VLDL); XL=very large (muy largo); XS=very small (muy pequeño); XXL=extremely large (extremadamente largo).

Los datos adicionales actualmente disponibles solo para investigadores en México

Datos de NMR metabolomics usando la plataforma de Nightingale Health

Segundo lanzamiento152,833 participantes en la encuesta basal y 9657 participantes en la reencuesta

Todos los metabolitos enumerados para el primer lanzamiento más Fosfoglicéridos, Piruvato, Aceto-acetata y LDL-C Clínico.

Datos Genómicos

Descripción completa en Ziyatdinov et al. 2023.

Genotipado de todo el genoma con Illumina Global Screening Array (GSA) versión 2

• Conjunto de datos no filtrado (140.831 participantes)650.381 variantes: 619,501 variantes autosómicas; 30,101 variantes de cromosomas sexuales; 779 variantes mitocondriales

• Conjunto de datos de calidad controlada (138,511 participantes) 559,923 variantes: 539,315 variantes autosómicas; 19,954 variantes de cromosomas sexuales; 654 variantes mitocondriales.

Secuenciación del exoma completo (WES)

• Conjunto de datos no filtrado (141,046 participantes) 13,331,228 variantes: 12,957,291 variantes autosómicas; 368,300 variantes del cromosoma X; 5637 variantes del cromosoma Y.

Secuenciación del genoma completo (WGS)

• Conjunto de datos no filtrado (9950 participantes) 158,464,363 variantes: 151,639,445 variantes autosómicas; 6,342,270 variantes del cromosoma X; 482,648 variantes del cromosoma Y.

Panel de referencia de imputación WGS en fases (EPCM10k)

• 9948 muestras en fases secuenciadas del genoma completo
• Total de 134,337,444 variantes distribuidas en 22 autosomas y cromosoma X
• Datos disponibles en cuatro formatos.

Imputados con el panel TopMed

• Conjunto de datos no filtrado (140,831 participantes) 307,624,124 variantes: 292,293,083 variantes autosómicas; 15,331,041 variantes del cromosoma X.

El EPCM ha publicado los resultados de proyectos de investigación sobre la relevancia para la mortalidad por causa específica de los factores de riesgo importantes, como diabetes^1-3, adiposidad^4-7, presión arterial⁸, consumo de tabaco⁹ y bajos niveles de educación¹⁰, y consumo de alcohol¹¹ Tambien hemos publicado varios análisis transversales relacionados con estos factores de riesgo^11-14 y otros factores de riesgo cardiometabólico como lípidos y otros biomarcadores^15-16. Además, los análisis actuales (cuya publicación está prevista para 2025) informarán sobre la relevancia para la mortalidad por causas específicas del la actividad física y función renal, así como la relevancia combinada de estos principales factores de riesgo para el riesgo cardiovascular. Si está interesado en estudiar cualquiera de estos factores de riesgo, le recomendamos que revise estos artículos publicados anteriormente (o se comunique con nosotros) para ver qué se ha publicado o qué se publicará próximamente del estudio.

Además, varias áreas de investigación están siendo exploradas actualmente por investigadores de doctorado o post-doctorado en Oxford y la UNAM y, por lo tanto, se consideran "protegidas" hasta la finalización del proyecto. Estos incluyen, pero no se limitan a, el estudio de la genética de la diabetes, la adiposidad, la presión arterial, la función cognitiva, la función renal y los lípidos en sangre, los estudios de aleatorización mendeliana de estos fenotipos y el uso de puntajes de riesgo poligénico para predecir la mortalidad cardiometabólica. Por lo tanto, aquellas solicitudes de proyectos que se superpongan considerablemente con proyectos protegidos podrán requerir de una discusión detallada antes de su aprobación.

Los proyectos externos (acceso abierto y colaboraciones) que ya han sido aprobados y tienen un acuerdo de acceso vigente (última actualización: 19 de marzo de 2025.)

1. Alegre-Díaz, Herrington, López-Cervantes et al. Diabetes and cause-specific mortality in Mexico City.
New Engl J Med 2016; 375: 1961-1971.

2. Herrington, Alegre-Díaz, Wade et al. Effect of diabetes duration and glycaemic control on 14-year
cause-specific mortality in Mexican adults: a blood-based prospective cohort study. Lancet Diab Endocrinol 2018; 6: 455-463.

3. Bragg, Kuri-Morales, Berumen et al. Diabetes and infectious disease mortality in Mexico City
BMJ Open Diab Res Care 2023;11:e003199.

4. Gnatiuc, Alegre-Díaz, Wade et al. General and abdominal adiposity and mortality in Mexico City:
prospective study of 150 000 adults. Ann Int Med 2019; 171: 397-405

5. Gnatiuc, Tapia-Conyer, Wade et al. Abdominal and gluteo-femoral markers of adiposity and risk of
vascular-metabolic mortality in a prospective study of 150 000 Mexican adults. Eur J Prev Cardiol 2022:29(5);730-8.

6. Alegre-Díaz, Friedrichs, Ramirez-Reyes et al. Body mass index and COVID-19 mortality: prospective
study of 120 000 Mexican adults. Int J Epidemiol. 2022;51(5):1698-700.

7. Gnatiuc Friedrichs, Wade, Alegre-Díaz etal. Body Composition and Risk of Vascular-Metabolic
Mortality Risk in 113 000 Mexican Men and Women Without Prior Chronic Disease. J Am Heart Assoc. 2023 Jan 25:e028263.

8. Tapia-Conyer, Alegre-Díaz, Gnatiuc et al. Association of blood pressure with cause-specific mortality
in Mexican adults. JAMA Network Open. 2020; 3: e201814.

9. Thomson, Tapia-Conyer, Lacey et al. Low-intensity daily smoking and cause-specific mortality in
Mexico: prospective study of 150,000 adults. Int J Epidemiol 2021; 50: 955-964.

10. Addey T, Alegre-Díaz J, Bragg F et al. Educational and social inequalities and cause-specific mortality
in Mexico City: a prospective study. Lancet Public Health 2023; 8(9): e670-e679

11. Trichia, Alegre-Díaz, Aguilar-Ramirez et al. Alcohol and mortality in Mexico: prospective study of 150 000 adults. Lancet Pub Health 2024; 9(11): e907-e915.

12. Kuri-Morales, Emberson, Alegre Díaz et al. The prevalence of chronic diseases and major disease
risk factors at different ages among 150 000 men and women living in Mexico City: cross-sectional analyses of a prospective study. BMC Public Health 2009, 9:9.

13. Aguilar-Ramirez, Alegre-Díaz, Gnatiuc et al. Changes in the diagnosis and management of diabetes
in Mexico City between 1998-2004 and 2015-19. Diabetes Care 2021;44(4):944-51

14. Gnatiuc, Alegre-Díaz, Halsey et al. Adiposity and Blood Pressure in 110 000 Mexican Adults.
Hypertension 2017; 69: 608-614.

15. González-Carballo, Kuri-Morales, Chiquete, et al. Cognitive impairment at older ages among 8000
men and women living in Mexico City: cross-sectional analyses of a prospective study. BMC Public Health 2024;24: 3620.

16. Aguilar-Ramirez, Alegre-Díaz, Herrington et al. Association of kidney function with NMR-quantified
lipids, lipoproteins, and metabolic measures in Mexican adults. J Clin Endocrinol Metab 2021; 106(10): 2828-2839.

17. Aguilar-Ramirez, Herrington, Alegre-Díaz et al. Adiposity and NMR-measure lipid and metabolic
biomarkers among 30,000 Mexican adults. Commun Med 2022; 2:143.