6. Datos disponibles

Para una descripción completa, revisar el Data Showcase de EPCM. El showcase muestra todos los datos que se encuentran disponibles al momento, presentando la información de forma agrupada (no a nivel individual), además de detalles de cada campo (p. ej. descripción de cómo ciertas mediciones fueron obtenidas). La variación genética se puede ver utilizando un buscador en línea de variantes disponibles en EPCM.

Detallado de los datos actualmente disponibles para investigadores a nivel mundial

Encuesta basal (1998-2004) Disponible para 159,517 participantes

Mes y año de reclutamiento

Socio-demográficos

• Edad
• Sexo
• Área de residencia 
• Estado civil
• Nivel educativo
• Ocupación
• Ingreso
• Proveedor de servicios de salud

Estilo de vida

• Consimo de tabaco
• Exposición pasiva a humo de tabaco
• Consumo de alcohol
• Actividad física
• Duración de sueño
• Consumo de frutas/vegetales
• Consumo de alimentos fritos
• Tipo de aceite comestible consumido

Enfermedades y uso de medicamentos

Historia reproductiva (mujeres)

• Menopausia
• Histerectomía
• Ooforectomía
• Terapia de reemplazo hormonal
• Uso de anti-conceptivos
• Edad de inicio de actividad sexual
• Edad de primer embarazo
• Número de embarazos

Antropometría

• Talla
• Peso
• Circumferencia de cintura
• Circumferencia de cadera
• Presión arterial sistólica
• Presión arterial diastólica

Muestras de sangre

• Timepo de la toma de muestra
• Tiempo desde el ultimo alimento
• Hemoglobina glicosilada

Re-encuesta (2015-2019) Disponible para 10,143 participantes. Similar a los datos recolectados en la encuesta basal más

Información adicional del cuestionario

• Preguntas de control de diabetes
• Complicaciones de diabetes (eg,ojos, amputaciones, diálisis)
• Fracturas y caídas
• Tratamiento de cancer de mama
• Preguntas adicionales sobre dieta (eg, bebidas azucaradas, sal agreada, carne, pescado, postre, dieta)
• Función cognitiva (MMSE) 

Mediciones adicionales

• Bioimpedancia (masa grasa, masa libre de grasa, masa muscular, score muscular, masa ósea, agua corporal, nivel de obesidad, grasa visceral, tasa metabólica basal, edad metabólica, índice de Rohrer)

Muestras adicionales

• Tiempo de muestreo urinario
• Creatinina urinaria
• Albúmina urinaria 

Datos de NMR metabolomics usando la plataforma de Nightingale Health Primer lanzamiento: 40,297 participantes

14 subclases de lipoproteínas

• XXL VLDL
• XL VLDL
• L VLDL
• M VLDL
• S VLDL
• XS VLDL
• IDL
• L LDL
• M LDL
• S LDL
• XL HDL
• L HDL
• M HDL
• S HDL

Tamaño promedio de lipoproteínas y apolipoproteínas

• VLDL-D
• LDL-D
• HDL-D
• Apo A1
• Apo B

Colinas y metabolitos relacionados con la glucólisis

• Colinas totals
• Fosfatidilcolina
• Esfingomielina
• Lactato
• Citrato
• Glucosa

7 mediciones lipídicas por cada subclase

• Número de partículas
• Colesterol
• Colesterol libre
• Colesterol esterificado
• Triglicéridos
• Fosfolípidos
• Lípidos totales

Ácidos grasos

• Poliinsaturados
• Monoinsaturados
• Saturados
• Ácido
• docosahexaenoico
• Ácido linoleico
• Omega-3
• Omega-6
• Ácidos grasos totales

Amino ácidos

• Alanina
• Glutamina
• Histidina
• Isoleucina
•  Leucina
• Valina
• Fenilalanina
• Tirosina

Cuerpos cetónicos, inflamación, y función renal

• Acetato
• Acetona
• β-hydroxy-butirato
• Albúmina
• Creatinina
•  Acetiles de glycoproteína

Datos de mortalidad (hasta el 30 de Septiembre de 2022)

• Fecha de fallecimiento
• Causa básica de muerte ICD-10
• Causas que contribuyeron a la muerte ICD-10
• Tiempo de duración de enfermedades
• Lugar de defunción 
•  Visto por medico previo a defunción 

Apo A1=apolipoproteína A1; Apo B=apolipoproteína B; HDL=high density lipoproteins (lipoproteínas de alta densidad); HDL−D=high density lipoprotein particle diameter (diámetro de HDL); IDL=intermediate density lipoproteins (lipoproteína de densidad intermedia); L=large (grande); LDL=low density lipoproteins (lipoproteína de baja densidad); LDL−D=low density lipoprotein particle diameter (diámetro de LDL); M=medium (mediano); S=small (pequeño); VLDL=very low density lipoproteins (lipoproteína de muy baja densidad); VLDL−D=very low density lipoprotein particle diameter (diámetro de VLDL); XL=very large (muy largo); XS=very small (muy pequeño); XXL=extremely large (extremadamente largo).

Los datos adicionales actualmente disponibles solo para investigadores en México

Datos de NMR metabolomics usando la plataforma de Nightingale Health

Segundo lanzamiento152,833 participantes en la encuesta basal y 9657 participantes en la reencuesta

Todos los metabolitos enumerados para el primer lanzamiento más Fosfoglicéridos, Piruvato, Aceto-acetata y LDL-C Clínico.

Datos Genómicos

Descripción completa en Ziyatdinov et al. 2023.

Genotipado de todo el genoma con Illumina Global Screening Array (GSA) versión 2

• Conjunto de datos no filtrado (140.831 participantes)650.381 variantes: 619,501 variantes autosómicas; 30,101 variantes de cromosomas sexuales; 779 variantes mitocondriales

• Conjunto de datos de calidad controlada (138,511 participantes) 559,923 variantes: 539,315 variantes autosómicas; 19,954 variantes de cromosomas sexuales; 654 variantes mitocondriales.

Secuenciación del exoma completo (WES)

• Conjunto de datos no filtrado (141,046 participantes) 13,331,228 variantes: 12,957,291 variantes autosómicas; 368,300 variantes del cromosoma X; 5637 variantes del cromosoma Y.

Secuenciación del genoma completo (WGS)

• Conjunto de datos no filtrado (9950 participantes) 158,464,363 variantes: 151,639,445 variantes autosómicas; 6,342,270 variantes del cromosoma X; 482,648 variantes del cromosoma Y.

Panel de referencia de imputación WGS en fases (EPCM10k)

• 9948 muestras en fases secuenciadas del genoma completo
• Total de 134,337,444 variantes distribuidas en 22 autosomas y cromosoma X
• Datos disponibles en cuatro formatos.

Imputados con el panel TopMed

• Conjunto de datos no filtrado (140,831 participantes) 307,624,124 variantes: 292,293,083 variantes autosómicas; 15,331,041 variantes del cromosoma X.